Search Europe PMC
Arguments
- query
A query string. Build one with
europepmc_query()to get the quoting right.- limit
Maximum results to return.
- ...
Passed to
biohttp::get_json(), for examplethrottle.
Value
A biohttp envelope whose data is a list of results (the tibble
from europepmc_parse_results()), count (Europe PMC's total, not the
page size), and query.
References
Ferguson et al. (2021). Europe PMC in 2020. Nucleic Acids Research 49(D1), D1507-D1514. doi:10.1093/nar/gkaa994
Service documentation: https://europepmc.org/
Examples
# \donttest{
biohttp::body_or_null(europepmc_search(europepmc_query("BRAF", "V600E")))
#> $results
#> # A tibble: 15 × 10
#> title authors year journal pmid doi cited_by source source_id source_url
#> <chr> <chr> <chr> <chr> <chr> <chr> <dbl> <chr> <chr> <chr>
#> 1 Impro… Yu N, … 2026 J Clin… 4275… 10.1… 0 MED PMID:427… https://e…
#> 2 Dabra… Kuriha… 2026 Int J … 4280… 10.1… 0 MED PMID:428… https://e…
#> 3 Relat… Okamot… 2026 Dent J… 4278… 10.3… 0 MED PMID:427… https://e…
#> 4 Pretr… Ma J, … 2026 NA NA 10.2… 0 PPR PPR:PPR1… https://e…
#> 5 Progr… Jin T,… 2026 Front … 4276… 10.3… 0 MED PMID:427… https://e…
#> 6 Lange… Li Q, … 2026 Cancer… 4272… 10.1… 0 MED PMID:427… https://e…
#> 7 Papil… Caputo… 2026 JCEM C… 4272… 10.1… 0 MED PMID:427… https://e…
#> 8 V600E… Zhang … 2026 RSC Adv 4258… 10.1… 0 MED PMID:425… https://e…
#> 9 A Flu… Lei Q,… 2026 Anal C… 4268… 10.1… 0 MED PMID:426… https://e…
#> 10 BRAF … Love J… 2026 Am J C… 4269… 10.1… 0 MED PMID:426… https://e…
#> 11 A sim… Cao B,… 2026 Gland … 4272… 10.2… 0 MED PMID:427… https://e…
#> 12 BRAF … Sagawa… 2026 J Gast… 4267… 10.1… 0 MED PMID:426… https://e…
#> 13 Lepto… Kitano… 2026 NMC Ca… 4270… 10.2… 0 MED PMID:427… https://e…
#> 14 Popul… Gill S… 2026 Clin C… 4279… 10.1… 0 MED PMID:427… https://e…
#> 15 Kinas… Zhao M… 2026 Am J S… 4263… 10.1… 0 MED PMID:426… https://e…
#>
#> $count
#> [1] 30960
#>
#> $query
#> [1] "\"BRAF\" AND \"V600E\""
#>
# }